Serwer NAS to tak naprawdę miniPC, o względnie niewielkiej wydajności (w porównaniu do nowoczesnych komputerów stacjonarnych), ale dzięki temu posiada niewielkie zapotrzebowanie na energię. Najważniejszą zaletę tych urządzeń stanowi oprogramowanie, dzięki któremu maleństwa te biją na głowę standardowe komputery w zakresie łatwości uzyskania określonych funkcjonalności. Oprogramowanie systemowe serwerów stanowi u większości producentów bardzo dobre i spójne narzędzie do obsługi wielu funkcji sieciowych. Nie jest jednak ani wygodne z punktu widzenia przejrzystości obsługi, a już na pewno nie jest potrzebne upychanie wszystkich rozwiązań w systemie, stąd też wiele dodatkowych możliwości można wykrzesać z serwerów plików za pomocą dodatkowych narzędzi i aplikacji.

QNAP udostępnia dodatkowe aplikacje - zarówno swoje jak i firm trzecich - za pośrednictwem App Center. Obecnie w Centrum dostępnych jest ponad 100 propozycji, które pozwalają na przekształcenie domowego czy firmowego NAS'a w serwer www, ftp czy też serwer poczty, nośnik dla bloga czy forum internetowego, centrum monitoringu, czy nośnik kopii zapasowych (to również przy pomocy podstawowych funkcji systemowych). Znajdziemy tu różnorakie narzędzia biznesowe, deweloperskie, do zarządzania treścią, narzędzia LMS (Learning Management System - systemy zarządzania nauczaniem) itd. itp.

W systemie domyślnie są zainstalowane aplikacje Music, Download i Photo Station. W razie pojawienia się aktualizacji do zainstalowanych w systemie programów wystarczy jedno kliknięcie myszą, a aktualizacje zostaną pobrane i zainstalowane automatycznie.

Po kliknięciu na dowolną ikonę jeszcze niezainstalowanej aplikacji pojawia się jej krótki opis (czasem w języku polskim, choć częściej jedynie po angielsku). Instalacja również nie sprawia żadnych kłopotów i sprowadza się do dwóch-trzech kliknięć.

QNAP dopuszcza sytuację, w której korzystanie z aplikacji będzie wymagało wykupienia dodatkowej licencji. Wówczas sytuacja nie jest tak prosta jak np. w przypadku aplikacji dostępnych na systemy mobilne, za które można zapłacić w trakcie procesu instalacji. Tu należy nabyć licencję w sklepie QNAP, a dopiero później można przystąpić do procesu aktywacji programu.