W tym miejscu system, sterowniki kontrolera dysku rozpoczną kontrolę nad dyskiem.
To właśnie w dużej mierze od nich będzie później zależało wykorzystanie dysku w sferze wydajności oraz stabilnej pracy.
Brak systemu spowoduje zawieszenie powyższych operacji, przy czym dysk cały czas pozostaje w fazie gotowości, a na ekranie monitora pojawi się komunikat stwierdzający brak systemu operacyjnego.
Wszelkie modyfikacje związane z utworzeniem partycji, jej aktywacją , podziałem z reguły dokonuje instalator systemu operacyjnego lub programy do tych celów dedykowane.
Znane są przypadki uszkodzeń bloku startowego dysku, w których takie oprogramowanie może pomóc (fixmbr, fixboot itp.).